Obok fary w 1738 r. została wzniesiona kaplica ku czci św. Jana Kantego, jednego z patronów olkuskiej parafii. Ten wykładowca Collegium Maius Akademii Krakowskiej otrzymał w 1439 r. probostwo w Olkuszu. Obowiązki uczelniane ponoć zmusiły go niebawem do rezygnacji z tej funkcji. Kaplica przypomina jednak o jego obecności i zamieszkiwaniu w parafii. Zwłaszcza, że od południa obiekt graniczy ze sklepioną izbą o masywnych ścianach, stanowiącą element miejskich murów obronnych z czasów średniowiecza. Tutaj, według miejscowej tradycji, miało być mieszkanie św. Jana Kantego.

Z pierwotnego wizerunku budynku kaplicy, sprzed jej przebudowy w 1897 r., pozostał późnobarokowy portal, zdobiący frontową ścianę zewnętrzną, zwieńczony m.in. herbem Akademii Krakowskiej. Dzisiejszy wystrój wnętrza kaplicy św. Jana Kantego ujęty jest w stylu neogotyckim i pochodzi z początku XX wieku. Jego twórcą jest Paweł Turbas, osiadły w Olkuszu znakomity snycerz, autor licznych dzieł rzeźbiarskich w wielu kościołach. W ołtarzu umieszczona jest kopia obrazu Tadeusza Kuntze-Konicza „Cud św. Jana Kantego”, którego oryginał, z ok. 1765 r., znajduje się w Muzeum Narodowym w Warszawie. Po bokach widzimy figury św. Wojciecha i św. Stanisława. Na postumencie przy ołtarzu jest figura Matki Bożej Fatimskiej, poświęcona przez św. Jana Pawła II podczas Mszy św. na ziemi sosnowieckiej w 1999 r.

Przy ambonie kolejny ślad św. Jana Kantego, przedstawiająca go drewniana figura z XVII wieku, przeniesiona do wnętrza kaplicy z wnęki nad portalem frontowej ściany. Naprzeciwko, po prawej stronie od wejścia, stoi współczesny odlew figury Jana Pawła II, ustawiony w 2014 r. Obok witryna z pamiątkami dotyczącymi pobytu w Ziemi Świętej olkuskiego proboszcza ks. prał. Stefana Roguli w 1999 r. Są to: krzyż z drewna oliwkowego oraz odłamki rodzimej skały z Morza Martwego i Pustyni Judzkiej. Witryna mieści także różaniec przekazany olkuskiemu proboszczowi przez Jana Pawła II podczas pielgrzymki do Ojczyzny w 1999 r. Kaplica ma współczesne wyposażenie w ławki i konfesjonał.

Od 30 listopada 2009 r., czyli od obchodzonej w parafii uroczystości jej głównego patrona św. Andrzeja Apostoła – w trosce o pogłębienie kultu Eucharystii – kaplica jest każdego dnia miejscem całodziennego wystawienia Najświętszego Sakramentu. Wierni mogą tu adorować Pana Jezusa Chrystusa, okazując Mu wdzięczność i miłość, a także modlić się za Kościół, za siebie i innych, o pokój i zbawienie świata. W kaplicy jest również stały konfesjonał. Kapłani spowiadają obecnie od poniedziałku do soboty w godz. 10-11.